ما NoScript را طوری پیکربندی می‌کنیم تا جاوااسکریپت به‌صورت پیش‌فرض در مرورگر Tor مجاز باشد زیرا بسیاری از وب‌سایت‌ها در صورت غیرفعال‌بودن جاوااسکریپت کار نخواهند کرد. اگر ما جاوااسکریپت را به‌صورت پیش‌فرض غیرفعال می‌کردیم، بسیاری از کاربران دیگر از Tor استفاده نخواهند کرد، چون مشکلات فراوانی برایشان پیش خواهد آورد. در نهایت، ما می‌خواهیم مرورگر Tor را تا حد امکان امن و درعین‌حال برای اکثر افراد قابل‌استفاده کنیم. بنابراین، در حال حاضر، این به‌معنای رهاکردن جاوااسکریپت به‌صورت پیش‌فرض فعال است.

برای کاربرانی که می‌خواهند جاوااسکریپت روی همهٔ سایت‌های HTTP به‌صورت پیش‌فرض غیرفعال باشد، ما تغییر گزینهٔ «سطح امنیتی» مرورگر Tor خود را توصیه می‌کنیم. این کار با پیمایش آیکون امنیت (سپر خاکستری کوچک در سمت بالا-چپ صفحه)، سپس کلیک‌کردن روی «تغییر…» امکان‌پذیر است. در سطح «استاندارد» جاوااسکریپت مجاز است، سطح «امن‌تر» جاوااسکریپت را در سایت‌های HTTP و سطح «امن‌ترین» به‌کلی جاوااسکریپت را مسدود می‌کند.