Si estás usando el Navegador Tor, puedes configurar la dirección, el puerto y la información de autenticación de tu proxy en Configuración de conexión.

Si estás usando Tor de otra manera, puedes establecer la información del proxy en tu archivo torrc. Comprueba la opción de configuración HTTPSProxy en la página de manual. Si tu proxy requiere autentificación, mira la opción HTTPSProxyAuthenticator. Ejemplo con autentificación:

  HTTPSProxy 10.0.0.1:8080
  HTTPSProxyAuthenticator myusername:mypass

En la actualidad, solamente soportamos autentificación Básica, pero si necesitas autentificación NTLM, podrías encontrar que este posteo en los archivos es útil.

Para usar un proxy SOCKS, mira las opciones Socks4Proxy, Socks5Proxy y otras relacionadas en torrc en la página de manual. Sería más o menos así:

  Socks5Proxy 10.0.0.1:1080
  Socks5ProxyUsername myuser
  Socks5ProxyPassword mypass

Si tus servidores proxy sólo te permiten conectar a ciertos puertos, lee la página clientes detrás de un cortafuegos para saber como restringir los puertos a los que Tor intentará conectarse.